In meinem Triple-Boot-System wechsele ich oft zwischen den Systemen (meist Win10 <-> macOS Mojave). Unter Win10 werden mir in jeder Partition mehrere Ordner angezeigt, die jeweils mit einem Punkt beginnen und wohl Systemordner von macOS sind. Unter macOS sind diese Ordner nicht sichtbar, unter Windows leider schon. Windows-Einstellungen wie "versteckte Ordner nicht anzeigen" oder "geschützte Systemodner nicht anzeigen" haben auf die Ansicht keinen Einfluß.
Ich nutze Paragon-Tools wie "APFS für Windows" und "NTFS für macOS", dies hat aber meines Erachtens keinen Einfluß darauf.
Ich weiß, es ist eigentlich ein Windows-Problem - ich frage trotzdem erstmal die versammelte Kompetenz hier.